L'ANCRA se compose de l'ensemble des CRA de France et des DOM.

L'Association Nationale est présidée par Madame Cathy Leroy (CRA Centre Val de Loire).

L'ANCRA est dirigée par un conseil d'administration  de 8 membres élus pour 3 ans par l'assemblée générale.Les membres sont rééligibles par tiers tous les ans.

Le Conseil d'Administration s'est adjoint un Conseil Scientifique et Technique.

Afin d'aider les Centres de ressources autisme dans leur démarche d'évaluation interne, l'association nationale a recruté une qualiticienne, Sarah Paccou (Contact), a élaboré le guide "Ancrage" et constitué un Comité de pilotage Qualité national.

Pour faire vivre son site national, le conseil d'administration a constitué un Comité de rédaction.